造成临床医生对许多慢性疾病诊断困难的一个出人意料的原因是甲状腺功能低下。这是因为其64个主要症状与其他许多疾病相似。甲状腺功能代谢如未被诊断或治疗，将影响每个细胞的代谢，对延长寿命的计划产生影响。忽视甲状腺功能低下，用抗生素治疗诸如上呼吸道感染等症状，会使基础疾病一直得不到治疗，继续破坏人体能量、健康状况以及思考和记忆能力等等。
甲状腺是人体内最大的内分泌腺，其重量不足1英两，一年分泌不足1茶匙容量的激素，但却调控人体所有的细胞的代谢活性。正如Barnes博士所说：“细胞的健康依赖于三个因素：营养成分的稳定供给、氧气和甲状腺激素。”甲状腺激素刺激氧化代谢，因此能增加每个细胞的氧消耗。
让临床医师困惑的许多慢性躯体疾病的原因就是甲状腺功能低下。甲状腺功能低下影响每一个主要器官，并深刻影响每一个细胞代谢效率。甲状腺功能低下的症状很多并且变化多端。甲状腺功能低下持续或未得到治疗将促进缩短寿命的疾病发生。
甲状腺功能低下促进胆固醇和甘油三酯升高，预示着心血管疾病的发生；体液异常聚集；思考和记忆困难；妇科疾病；性别障碍；贫血甚至骨质疏松。
甲状腺功能低下的各种症状其他很多疾病也会出现，例如：肌肉骨骼系统的病变如严重的肌肉痉挛（尤其在晚上），持续的腰背疼，血液系统异常（三分之一到二分之一的甲状腺共轭能低下患者表现出血细胞总量，导致贫血），凝血异常（容易擦伤、轻微出血、月经过多等），风湿病症状（四肢强直、手足关节痛和感觉异常且以关节强直而非疼痛为主），肌肉疼痛和关节囊积液（主要是膝关节），高尿酸血症，心肌收缩性减弱。临床治疗发现甲状腺激素替代治疗可以减轻或逆转这些症状。
由甲状腺分泌的甲状腺素多数是以T4，即四碘甲状腺原氨酸（每个分子包括4个碘原子）的形式存在的，有促进细胞代谢、增加氧消耗、刺激组织生长、成熟和分化功能。
在甲状腺器官开始运用它之前，T4需要被转化为其他活性成分T3，T3（三个碘原子）是被我们体内所利用的形式：
TSH水平显示我们的器官是否有足够的甲状腺素可利用
T4水平告诉我们甲状腺是否分泌出足够的甲状腺素
T3水平告诉我们体内需要从T4转化为T3的活动是否已经被有效转化
一些研究人员建议总T4的正常低值应该在65~70 mcg/L (微克每升) 之间，而不是50 mcg/L，因为研究发现，当总T4的正常值为65 mcg/L时，甲状腺功能低下的患病率增加5倍。其他甲状腺激素的正常参考值也存在同样的状况。
甲状腺疾病的检查应该以血液检查作为一种参考辅助基础体温测试，在临床上，对于症状高度提示为甲状腺功能低下而血液检查结果不支持该诊断的患者而言，基础体温测试要比血液检查更敏感。
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