子宫内膜异位症是多种因素疾病，至今病因不明。研究证明，子宫内膜存在干细胞，这些干细胞介导子宫内膜的周期性再生。越来越多的研究提出了子宫内膜异位症的干细胞起源学说，认为子宫内膜干细胞异常分化增殖可能导致子宫内膜异位症发生。

子宫内膜异位症是雌激素依赖的多因素疾病，育龄期妇女的发病率高达10%-15%。子宫内膜异位症是具有侵袭性的良性疾病，其病变广泛、形态多样，有浸润、转移及复发等恶性生物学行为，被形象地称为“良性癌”，可引起痛经、慢性盆腔痛、生育能力低下及月经失调等症状。其发病机制尚不完全清楚，研究发现，子宫内膜干细胞与月经周期中子宫内膜的高度可再生能力和某些妇科良性疾病的发生具有相关性，并因此提出子宫内膜异位症可能是一种干细胞疾病。

干细胞是一类具有自我更新、无限增殖和多向分化潜能的未分化细胞群。可分为胚胎干细胞、诱导多能干细胞和成人干细胞。目前国内外研究热点是成人干细胞。正常情况下，它存在于一种同时的微环境中。其主要由多种可溶性分子、肿瘤相关巨噬细胞、成纤维细胞等间质细胞组成。

有学者报道男性患者长期、大量使用雌激素治疗后，加上本身疾病等其他因素形成合适的环境，也能诱导局部干细胞分化为子宫内膜细胞，进而在泌尿道形成子宫内膜异位病灶。随着研究的深入，对干细胞与子宫内膜异位症的关系有了初步了解。